2012年中国科学院超级计算中心分子模拟软件讲习班通知

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2012年中国科学院超级计算中心分子模拟软件讲习班通知
为普及和推广高性能计算化学软件使用、培养高性能计算化学专业人才,中科院计算机网络信息中心理论物理研究所、清华大学将于201291720日在北京联合举办2012年分子模拟软件LAMMPS &GROMACS讲习班。
本次培训将面向LAMMPSGROMACS软件使用、本着理论指导实践、学以致用、加强交流”目的,利用中科院超算中心高性能计算机系统“深腾7000”所提供的一流高性能计算软硬件环境,为广大学员带来高性能计算化学的深度体验。在培训期间,我们将为广大学员提供上机实践的机会。
LAMMPS全称“大规模原子分子并行模拟器”,主要用于分子动力学相关的一些计算和模拟工作。它可支持包括气态,液态或者固态相形态下、各种系综下、百万级的原子分子体系,支持多种势函数并具有良好的并行扩展性。
GROMACS是用于研究生物分子体系的分子动力学程序包。它可以用分子动力学、随机动力学或路径积分方法模拟溶液或晶体中的任意分子,进行分子能量的最小化,分析构象等。它的模拟程序包包含GROMACS力场(蛋白质、核苷酸、糖等),研究的范围可以包括玻璃和液晶、到聚合物、晶体和生物分子溶液。GROMACS是一个功能强大的分子动力学的模拟软件,其在模拟大量分子系统的牛顿运动方面具有极大的优势。
 培训对象
深腾7000用户、从事计算化学、计算材料、计算生物等研究的科研院所和高校教师、研究生、科研工作人员及相关企业工程师。
 培训时间
2012917日~20日,报名截止时间:201295日,名额有限,报名从速。
 培训费用包括教材费、培训费、上机费、午餐费
科学院院内学员:¥800/人;
院外教育科研学员:¥1000/人;
企业单位学员:¥1200/人。
 培训地点
中国科学院计算机网络信息中心5514会议室
详细地址:北京市海淀区中关村南四街四号中科院软件园区2号楼
 报名方式
按照报名回执表的要求填写各项内容,然后发邮件到liuqian@sccas.cn ,我们将在一个工作日之内给予回复。联系人:刘倩博士,联系电话:010-58812143
 付款信息
电汇(推荐)截止日期2012910日(含)。凭汇款单在签到时领取发票(发票项目:超算计算化学培训费),请在回执中填写正确的发票单位名称及超算计算化学培训。
收款单位全称:中国科学院计算机网络信息中心
开户行名称:中国工商银行海淀支行营业部
账号:0200049609200016431
现场付款签到当天可以直接用现金或支票付款,并开具发票
拟定培训内容
  •  LAMMPS
    •  LAMMPS软件理论知识和软件使用方法
    •  LAMMPS软件上机实践、软件安装编译  
  •  GROMACS
    •  GROMACS软件理论知识和软件使用方法
    •  GROMACS软件上机实践、软件安装编译
  •  中国科学院超级计算环境介绍
  •  GPU加速LAMMPSGROMACS计算介绍
  •  LAMMPSGROMACS软件应用实例
市内乘车路线
1、机场乘车线路:乘坐民航班车(首都机场—中关村)终点(即四环保福寺桥)下车,换乘641或619到海淀交通支队站下车;
2、北京西客站乘车线路:乘坐319到海淀交通支队站下车;
3、北京站乘车线路:乘坐地铁2号线到西直门站,换乘城铁13号线到知春路站下车。
附近公交站:海淀交通支队、知春里东站,具体公交路线请查询:http://www.bjbus.com/index.htm
 
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