pDynamo

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作者或出品公司: 
不详
最新版本: 
1.9
评分: 
3

简介  
pDynamo是用量子化学、分子力学和杂化QC/MM势函数方法模拟分子体系的开源程序库。程序早期版本用Fortran 90/95编写(fDynamo),如今用Python和C混合编写。

功能  
1. 高斯基组密度泛函方法
2. 半经验MNDO类型的方法,包括AM1,MNDO,PDDG,PM3,RM1
3. 支持一些标准的MM力场,包括AMBER,CHARMM,OPLS-AA
4. 杂化方法QC/MM
5. 与第三方量子化学程序进行组合
6. 计算类型:能量计算,结构优化,过渡态搜索,反应路径,简正模式分析,计算电荷和偶极矩,分子动力学模拟,蒙特卡罗模拟
7. 各种结构限制
8. 能够处理各种文件格式
9. 大量分析工具