PUPIL

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作者或出品公司: 
不详
最新版本: 
3.1
评分: 
3

 简介
用户接口程序,允许用户把多个计算程序进行连接,自动执行QM/MM-MD框架下的多标度模拟。

功能
1. 图形用户界面下创建主要的模拟输入文件
2. 多个外部程序之间多标度模拟
3. Amber 10/11/12/14接口
4. DeMon2k 4.2.4接口
5. DL_CLASS_1.9(DLPOLY)接口
6. NWChem 6.1.1/6.3/6.5接口
7. Gaussian 03/09接口
8. Siesta 3.2接口
9. MNDO97接口

PUPIL 3.1的新功能:
1. 创建主要模拟输入文件的GUI
2. 管理程序加载不同计算单元的多标度模拟
3. 基于Ewald求和的长程静电
4. 多个活性区的QM/MM-MD(maz-QM/MM-MD方法)
5. 接口:Amber v10到v16;DL_CLASS v1.9(DL_POLY);Gaussian 03和09;deMon2k v4.3.8;NWChem v6.1.1,v6.3到v6.6;Siesta v4.0;mndo97;MOPAC2016;ORCA 3.0.3
6. stubMD:接口取样和测试的Stub程序,用于分子动力学计算单元
7. stubQM:接口取样和测试的Stub程序,用于循环量子力学计算单元
8. stubDI:接口取样和测试的Stub程序,用于外部域识别计算单元