Schrödinger Suite

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最新版本: 
2017.3
评分: 
3

简介  
Schrödinger公司开发的药物设计软件套装。所有程序使用Maestro图形用户接口。

功能  
CombiGlide结合了准确的配体-受体打分,巧妙的组合对接算法,和高效的内核切换技术,用于设计重点的数据库和辨认新的蛋白骨架。
Desmond用于对生物分子体系进行高效的分子动力学模拟。Desmond对速度和精度的平衡使得它可以用分子动力学模拟长时间标度的分子,甚至用来检测具有生物学和药学意义的事件。
Epik可以快速准确地预测pKa。
Glide提供了完整的配体-受体对接求解方案。
Jaguar是著名的密度泛函和从头量子化学计算程序。
KNIME Extensions使用著名的开源KNIME接口,用于自动生成流程图和进行数据分析。
Liaison可以高效准确地预测配体-受体的结合自由能。
LigPrep产生准确的3D分子模型。
MacroModel结合了领先的力场(MM2,MM3,AMBER,AMBER94,MMFF,OPLS,MMFFs,OPLS-AA),准确高效的有效溶剂模型,以及高级的构象搜索方法,提供了最完整的分子模拟程序套件。
Maestro是强大的多用途的分子模拟图形环境,学术用户可以免费申请使用。
Phase是高效率的配体药物设计程序。
Prime用于准确预测蛋白质结构。
PrimeX使用OPLS-AA力场,用于准确预测蛋白质晶体结构。
QikProp可以快速预测可能的药物。
QSite是QM/MM程序,QM区的计算使用Jaguar,可以用Hartree-Fock,DFT,或局域MP2方法求解。
SiteMap是快速准确的结合位识别程序。
Strike是强大的统计模拟和QSAR程序。
PyMOL产生分子图像和动画。
Schrödinger’s Materials Science Suite 2016.4加入Quantum ESPRESSO 6.0的接口。