GaussView

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作者或出品公司: 
Gaussian Inc.
最新版本: 
6.0
评分: 
5

GaussView是Gaussian的图形用户界面,用于观察分子,设置和提交Gaussian计算任务,显示结果。

GaussViewGaussView
GaussView 2.0功能:
  (1) 简单快速地构造分子
  可以使用原子,环,基团和氨基酸;从其它程序获取结构;对PDB文件自动加氢;用鼠标检查和修改结构参数;放大和缩小功能;平滑地三维旋转,即使是对大分子;四种显示模式:线形,管型,球棍,以及连接球。

  (2) 设置Gaussian的计算
  支持Gaussian的全部主要计算功能;自动确定电荷和自旋多重度;定义任务类型和化学模型;简单设置ONIOM计算;自动设置适当的Link 0命令;随时监测计算。
  (3) 显示Gaussian的计算结果
  优化的结构;分子轨道;振动频率的简正模式;原子电荷;电子密度曲面;静电势曲面;NMR屏蔽密度;曲面可以用实面,半透明和网格形式显示;曲面可以按照不同的特性着色。
  (4) 出版质量的输出
  支持PostScript,JPEG,PNG,以及TIFF格式。

  GaussView 3.0的新功能:
  (1) 创建三维分子模型
  根据需要显示或隐藏构造面板;允许自定义分子片断库;校正分子的方向;按照对称性限制分子的结构;对一维、二维和三维周期体系的计算,根据空间群创建结构单元。
  (2) 计算任务设置全面支持Gaussian 03
  支持定义冗余内坐标;从菜单选择溶剂;设置周期体系的计算;设置用于QST2和QST3过渡态寻找的分子说明。使用图形MO编辑器,对CASSCF计算选择轨道,并可对轨道重新排序和制定占据数;通过定制脚本运行远程任务。
  (3) 显示Gaussian结果。
  可以对简正振动,结构优化过程,曲面扫描,内反应坐标路径,BOMD和ADMP计算的分子动力学轨迹等,进行动画显示;显示各种计算的光谱,包括IR,Raman,NMR和VCD;定制元素、曲面、电荷和背景色。

GaussView 4.0的新功能:
(1) 查看和创建分子
修改分子对称性;显示立体化学信息;增强的用户片断库;配置工具;方便的上下文菜单。
(2) 运行Gaussian任务
计算方案;快速提交计算。
(3) 显示Gaussian结果
双变量扫描结果的3D绘图;等高线图;紫外可见光谱图;偶极矩矢量;支持含频计算;绘制其它特性;定制绘图和光谱;保存电影。
(4) GaussView每日提示。 

GaussView 5.0的新功能:
1. 检查分子结构:自定义显示布局;永久突出原子。
2. 创建和修改分子:分子文件格式(在输入的PDB文件中加入和去掉水;选择标准残基连接;对mol2文件包含或转换孤对电子);把原子或片段放在选定原子团的质心;原子团命名;非标准同位素。
3. 指定任务类型:分配ONIOM层的原子(辅助结构;复杂的选择标准);定义片段,用于片段的猜测或平衡计算,以及指定片段的电荷和自旋多重度;在分子说明中包含PDB数据;选择模式进行频率计算;指定用于NMR自旋-自旋耦合的原子。
4. 运行Gaussian计算:支持Gaussian 09全部功能;设置并行和多核任务;每个片段的多重度和电荷。
5. 显示Gaussian结果:显示模式的子集;把简正模式保存到checkpoint文件;在频率分析/简正模式中替换同位素;反向播放动画。
6. 定制GaussView:分子窗口的背景颜色。

GaussView 6.0的新功能:
显示结果的功能
1. 非谐频率分析:显示IR,Raman,VCD,和ROA光谱的谐频和非谐频分析的结果
2. PCM溶剂空穴:显示SCRF计算的溶剂空穴
3. ORD:绘制光学旋转位移计算的结果
4. 振动光谱:显示振动分析的结果,包括振动光谱和Duschinky矩阵
5. 增强了计算总结:Overview标签显示计算的关键信息,新的条目包括溶剂化模型和极化率;频率计算任务激活Thermo标签,列出各种热化学量;优化任务激活Opt标签,列出优化步骤的进度
6. 保存电影:把简正模式动画保存为MP4视频文件。
7. 组合图:把多个图组合为一个图
任务设定功能
1. 一步设定多个任务:可以对一组分子设定Gaussian任务
2. GMMX构象搜索
3. 本地计算机的SC任务队列管理系统
4. 对称性:降低分子对称性
5. 选择原子的刷子工具
6. 新的任务设定功能:预览输入文件;从checkpoint文件提取数据和指定%OldChk指令;指定任务的最大磁盘使用量;新的任务类型包括预测极化率和ORD;指定布居分析的扩展面板;支持Gaussian 16的新功能;查看Default.Route文件的内容