MOE

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最新版本: 
2016.08
评分: 
3

简介  
图形界面的分子操作环境。可用于药物开发,分子结构设计,蛋白质模拟和生物信息学,化学信息学和QSAR,药物化学应用,高产量研究,分子模拟,和方法的开发。

功能  
理论化学方面的功能有:
1. 创建分子模型,输入/输出分子数据。
2. 分子力学和动力学。MOE包含了集成的、多处理器的、公开参数的力场引擎。力场参数包括AMBER 89/94/99,CHARMM 22/27,MMFF94(s),OPLS-AA,和Engh-Huber模型。提供三种大标度能量最小化算法,并可以对键长、键角和扭转角施加束缚。MOE支持自动NVE,NVT,NPT,和NPH分子动力学模拟,并且可以加入原子墙限制。
3. 包含溶剂的静电影响。
4. 构象分析。
5. 灵活的小分子定位。
6. 衍射模拟,预测在气相、非晶液相、粉末或单晶相下,X射线、中子、电子衍射实验的结果。
7. 量子力学计算。MOE提供到从头计算、半经验和密度泛函代码的接口,包括GAMESS,Gaussian,ADF,MOPAC,和MOPAC 2007。通过使用图形接口设定计算和显示结果,如电子密度等高线,分子轨道图,能级图,以及其它特性。用MOE/smp可以对一组化合物的计算进行管理。