WebMO

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最新版本: 
17.0
评分: 
3

简介  
基于网页浏览器的计算化学图形界面。WebMo可以免费下载使用,每个计算时间限定为180 CPU秒。WebMO Pro无功能限制,需要付费购买,更适合于教育、科研和商业用户。

功能  
WebMo的功能:
1. 完整的Java 3D分子编辑器。
    易用的点击-绘制界面
    真正的3D转动,平移和调整图象大小
    可以使用前92个元素
    显示和校正键长、键角、二面角
    自动加氢,设定杂化,根据需要设定键长和键角
    直接把已存在的XYZ,MOL或PDB结构加载到编辑器中
    直接把已存在的Gaussian 9x/03,GAMESS,Molpro 2002和MOPAC 6/7/2000/2002输入文件加载到编辑器中
    扩展的分子片断库
    平移和转动选择的片断
2. 支持Gaussian 94/98/03
    内置支持单点能,几何优化,过渡态优化,鞍点计算,IRC计算,振动频率,NMR位移,UV-Vis光谱,键级分析,坐标扫描,分子轨道和自然轨道,以及用户指定的任务通过用户编辑模版文件,完全支持定制的计算
    内置支持从头计算(Hartree-Fock,MP2),DFT,半经验(AM1,PM3)计算,以及用户指定的理论级别
    对新手建议的基组,更多控制的用户指定基组
    Gaussian输入文件在提交前可以完全访问
    支持Gaussian的checkpoint文件
3. 支持GAMESS(1999年六月版或更高)。
    内置支持单点能,几何优化,过渡态优化,IRC计算,振动频率,NMR位移,紫外可见光谱,分子轨道,以及用户指定的任务
    通过用户编辑模版文件,完全支持定制的计算
    内置支持从头计算(Hartree-Fock,GVB,CCSD)和DFT理论级别
    对新手建议的基组,更多控制的用户指定基组
    GAMESS输入文件在提交前可以完全访问
4. 支持PC-Gamess。
    内置支持单点能,几何优化,过渡态优化,振动频率,紫外可见光谱,IRC计算,分子轨道,以及用户指定的任务
    通过用户编辑模版文件,完全支持定制的计算
    内置支持从头计算(Hartree-Fock,GVB)和DFT理论级别
    对新手建议的基组,更多控制的用户指定基组
    PC-Gamess输入文件在提交前可以完全访问
5. 支持Molpro 2002/2006。
    内置支持单点能,几何优化,过渡态优化,振动频率,分子轨道,坐标扫描,以及用户指定的任务
    通过用户编辑模版文件,完全支持定制的计算
    内置支持从头计算(Hartree-Fock,MP2,CCSD),DFT,以及用户指定的理论级别
    对新手建议的基组,更多控制的用户指定基组
    Molpro输入文件在提交前可以完全访问
6. 支持MOPAC 6/7/2000/2002/2007。
    内置支持SCF能量,几何优化,过渡态优化,鞍点计算,IRC计算,振动频率,热化学,以及用户指定的任务
    通过用户编辑模版文件,完全支持定制的计算
    内置支持PM3,AM1和MINDO哈密顿量
    对新手建议的基组,更多控制的用户指定基组
    MOPAC输入文件在提交前可以完全访问
7. 支持NWChem 4/5。
    内置支持单点能,几何优化,振动频率,NMR位移,IRC计算,紫外可见光谱,坐标扫描,分子轨道,以及用户指定的任务
    通过用户编辑模版文件,完全支持定制的计算
    内置支持从头计算(Hartree-Fock,MP2,CCSD),DFT,以及用户指定的理论级别
    对新手建议的基组,更多控制的用户指定基组
    NWChem输入文件在提交前可以完全访问
8. 支持Q-Chem 2/3。
    内置支持单点能,几何优化,振动频率,NMR位移,激发态,坐标扫描,分子轨道和自然轨道,以及用户指定的任务
    通过用户编辑模版文件,完全支持定制的计算
    内置支持从头计算(Hartree-Fock,MP2,CCSD),DFT,以及用户指定的理论级别
    对新手建议的基组,更多控制的用户指定基组
    Q-Chem输入文件在提交前可以完全访问
9. 支持Tinker 4。
    内置支持单点能,几何优化,振动频率和鞍点计算
    通过用户编辑模版文件,完全支持定制的计算
    支持MM2,MM3,和OPLS/AA力场
    Tinker输入文件在提交前可以完全访问
10.图形和文本显示结果。
    3D浏览器可以转动,平移和调整图象大小
    以各种格式输出结构
    显示振动模式
    显示IR/NMR光谱
    显示UV-Vis光谱
    显示部分电荷
    显示偶极矩
    可以访问未处理的输出文件
    能量,热化学,转动常数等的表格
11.用于任务组织和控制的任务管理器。
    访问过去的和当前的WebMO任务
    基于文件夹的任务管理系统
    显示、删除和下载过去的WebMO任务
    杀死当前运行的WebMO任务
    重新开始失败的任务
    访问未处理的任务输出
    任务完成后发Email通知
    下载完成任务的输出
    加载已存在的计算化学任务
12.完全在线管理。
    添加、编辑、禁止、或删除WebMO用户
    限定用户CPU时间,即可以对每一个任务也可以累积
    对所有的WebMO用户显示、下载和删除任务
    配置系统和WebMO设置
    配置计算化学界面
13.设置支持的浏览器有:
    Windows:IE 4.0+,Netscape 4.x,Netscape 6.2+,Mozilla 1.1+等;
    Unix/Linux:Netscape 4.x,Netscape 6.2+,Mozilla 1.1+等;
    Mac OS X:Netscape 6.2/7.0,Mozilla 1.2.1(不支持Mozilla 1.4+)
WebMO 5.0增加了:
    支持NWChem 4.6,Q-Chem 2.1,和Tinker 4.2
    对GAMESS增强了DFT、CCSD、NMR和紫外-可见光谱计算的支持
    WebMO编辑器增加了分子力学的优化

WebMO 6.0增加了:
    增强了3D图形的表现形式;
    振动模式,几何优化和IRC路径的动画;
    支持以上计算程序的最新版本;
    MOViewer用于显示分子轨道,NBO,以及等值面(只在专业版提供)。
    增加对Windows的支持,浏览器有Internet Explorer,Firefox,Netscape,Opera。

WebMO 7.0增加了:
    分子力学编辑器改善了初始结构;
    清除特定类(碳阳离子、碳阴离子等);
    自动诊断任务失败的原因;抓取JPEG图片;
    MOViewer增强了功能、执行效率和兼容性;
    鼠标控制的坐标扫秒,不再需要z-matrix编辑器;
    外部用户通过NIS、LDAP等认证的实验性支持。

WebMO 8.0增加了:
    WebMO和WebMO Pro完全在Windows下安装,不再需要UNIX/Linux服务器;
    支持PC-Gamess;
    结构优化中间能量的分析、显示及绘图;
    通过PAM,NIS,LDAP,POP3等支持外部用户认证;
    运行PBS/NIS/SGE/LSF排队的任务;
    把用户的任务保存到相应的主目录;
    使用外部认证时,自动创建WebMO帐户;
    升级了WebMO编辑器的分子片;
    WebMO用户支持真名,这将在用户管理中显示;
    二进制WebMO数据库和XML相互转化的命令行工具。

WebMO 9.0增加了:
    二维坐标扫描和等高线图;
    内置的排队系统支持多核;
    排队系统支持SMP并行(Windows,Linux,MacOS X);
    在任务管理器中搜索已存在的任务;
    任务模版编辑器;
    用户定义变量,用于加入任务的选项;
    升级任务模版系统;
    显示和分析球形/笛卡尔型MO;
    支持PQS;
    显示失败的、运行的、或部分完成的任务;
    保存任务选项,在重新开始计算任务时自动恢复;
    用TAR或ZIP格式压缩任务;
    所有的小程序内嵌到同一页面中,看起来更清晰。

WebMO 9.1增加了:
    兼容PC-Gamess 7.1;
    兼容MOPAC 2009;
    改变屏幕尺寸;
    杀死任务前的确认。

WebMO 10.0增加了:
    支持Gaussian 09,PSI 3,Vista/Windows 7;
    振动频率换算因子;
    改善了对ROHF计算的支持;
    把动画存为电影(动画GIF文件);
    把模拟的光谱存为数据文件;
    在Gaussian中分析和显示自然布居分析和ESP电荷。

WebMO 12.0增加了:
    探测点群对称性,结构对称化,显示对称元
    直角坐标编辑器
    改善了对Gaussian,Mopac,Gamess,Q-Chem,Molpro程序的支持
    标注NMR峰

WebMO 12.1增加了:
    分析拉曼谱
    显示红外/拉曼强度
    从光谱显示程序输出JCAMP-DX
    改进了编辑状态栏中的键长、键角、二面角的显示

WebMO 13.0增加了:
    Editor组件支持周期体系(1D,2D,3D)
    Editor组件对大体系提高了性能
    创建界面,显示密勒面
    支持PWSCF(Quantum Espresso)
    支持VASP
    支持PSI 4
    显示力,梯度,和态密度
    周期体系支持输入CIF文件

WebMO 14.0增加了:
    Java兼容性升级
    Huckel分子轨道计算

WebMO 15.0增加了:
    支持最新PSI 4
    支持Q-Chem 4.2

WebMO 16.0的新功能:
1. 支持iOS和Android WebMO免费app
2. 支持最新版的ORCA,PSI,和Q-Chem
3. WebMO编辑器中支持氢键
4. 创建/清除稠环化合物的改善
5. 加入HTML5用户接口元素:在目录间拖拽任务,更少的弹出窗口,任务运行过程中即时更新输出,可扩展的结果页面
6. 支持无限个数的用户目录及子目录(专业版)
7. 更好地支持通过外部队列系统指定计算资源(专业版)
8. 各种Bug修复。
9. 新的通信程序减少/排除了Java安全警告
10.支持最新的GAMESS和MOPAC
11.通过查询创建结构的功能支持化合物名称(如aspirin或vancomycin)
12.连接到外部数据库,查询分子性质,谱,以及数据
13.在Build Molecule页面计算Huckel分子轨道(专业版)

 

WebMO 16.1的新功能:
1. 支持MOPAC 2016
2. 升级了对PSI4的支持

WebMO Pro除了包括WebMO的全部功能外,还有以下功能:
1. 支持多个远程计算服务器。
2. 显示分子轨道,NBO,NHO,NAO。
3. 显示电子密度,静电势,以及亲电子/亲核表面(仅对Windows/PC用户)。
4. 改善了任务的组织结构,用户可以无限制地自定义文件夹。
5. 可以创建电子表格概要,用来比较多个任务的结果。
6. 集成的Z-矩阵编辑器。
7. 一维坐标扫描(用于Gaussian和MOPAC。WebMO Pro 7.0还支持NWChem和Molpro)。
8. 结合了其它的可视化和分析程序。
9. 每个用户的计算任务模版。
10.到现有PBS和NQS批量队列系统的接口。
11.显示NBO。