TRITON

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最新版本: 
4.0
评分: 
3

简介  
蛋白质变异模型和评估其活性的X Window图形界面软件。包含MOPAC插件。

功能  
TRITON 3.0的功能:
新的模块:量子化学计算模块MOPAC 7.01,MODELLER 6v2
对几何优化,单点能以及过渡态的MOPAC计算,新增加优化向导
增加到MOPAC2002的端口,能进行MOZYME和PM5计算
设置和运行连续的反应(仅用于MOPAC2000和MOPAC2002)
可以把每个MOPAC计算的结构保存为单独的.pdb文件
可以同时驱动一个体系内的两部分原子距离,每一部分的扫描步长可以不同。
添加“选择临域”选项。加入了这个选项的反应向导和优化向导可以简化对原子和整个残基的选择,只需要指定距离来选择原子/残基
新的静电变化图可以显示:(1)所选原子的部分电荷或整个残基的电荷在模拟反应过程中的变化;(2)在反应过程中所选原子/残基之间的静电相互作用能的变化。
改善了残基相互作用图,可以显示所选残基对特定原子的静电相互作用能。

TRITON 4.0的新功能:
1. 配体-蛋白质对接使用外部程序AutoDock
2. 显示对接的输出结构和亲和图
3. 支持新版本的MODELLER 9v3,MOPAC 7.1,MOPAC2007
4. 更好地支持多个结构,更容易改变颜色和渲染
5. 用RMSD最小化拟合结构
6. 为原子加氢的新工具
7. 新的实时帮助
8. 预配置用来保存和调用最近对原子/分子的选择/能见度/颜色/渲染
9. 创建AVI格式的动画
10.新的结构绘图可以显示键长、键角、扭转角的变化