Vega

  • strict warning: Non-static method view::load() should not be called statically in /home/vasp/wwwroot/drupal-6.33/sites/all/modules/views/views.module on line 906.
  • strict warning: Declaration of views_handler_argument::init() should be compatible with views_handler::init(&$view, $options) in /home/vasp/wwwroot/drupal-6.33/sites/all/modules/views/handlers/views_handler_argument.inc on line 744.
  • strict warning: Declaration of views_plugin_row::options_validate() should be compatible with views_plugin::options_validate(&$form, &$form_state) in /home/vasp/wwwroot/drupal-6.33/sites/all/modules/views/plugins/views_plugin_row.inc on line 134.
  • strict warning: Declaration of views_plugin_row::options_submit() should be compatible with views_plugin::options_submit(&$form, &$form_state) in /home/vasp/wwwroot/drupal-6.33/sites/all/modules/views/plugins/views_plugin_row.inc on line 134.
最新版本: 
2.3
评分: 
3

简介  
类似于Babel,转换分子模型格式的程序,并有显示和分析分子三维结构的功能。

功能  
VEGA 1.0:
1. 3D引擎和图形用户界面(仅Win32程序)。
2. 支持的输入文件格式:MSI Quanta/CHARMm CRD和DCD轨迹,剑桥数据文件(CSSR),QMC,Gromos,IFF,Mol2,MSI Quanta MSF,PDB,PDBF,Insight II,MoPac内坐标,直角坐标XYZ。
3. 支持的输出文件格式:MSI Quanta/CHARMm CRD,剑桥数据文件(CSSR),Fasta,Gromos,IFF,Mol2,MSI Quanta MSF,PDB,PDBQ,PDBF,简化PDB,Insight II,MoPac内坐标,MSI/Biosym曲面,MSI Quanta曲面,VRML,直角坐标XYZ。
4. 原子电荷分析。
5. AMBER,CHARMm,CVFF,MENG的力场分析。
6. 计算分子曲面。
7. 计算配合基-受体的相互作用能。
8. 求解logP和lipole。
9. 动态轨迹分析。
10.坐标归一化。

VEGA ZZ 2.0:
1. 引入超级驱动技术,提高了计算速度
2. 新的图形界面
3. 改善了图形效果(光源引擎和定制显示)
4. 管子和轨迹显示模式
5. 快速的实体表面和网格表面的计算,以及多个曲面的管理
6. 支持立体效果和分布式OpenGL图形
7. 标准版包含了MLP/Virtual logP
8. 添加氨侧链的功能
9. 检查蛋白质结构的工具
10.增强了图象表现能力
11.LaTex,PDF,PS和EPS输出

VEGA ZZ 2.3:
1. 图形界面完全支持NAMD 2 MD。
2. 支持Mopac 2009。