Viewmol

  • strict warning: Non-static method view::load() should not be called statically in /home/vasp/wwwroot/drupal-6.33/sites/all/modules/views/views.module on line 906.
  • strict warning: Declaration of views_handler_argument::init() should be compatible with views_handler::init(&$view, $options) in /home/vasp/wwwroot/drupal-6.33/sites/all/modules/views/handlers/views_handler_argument.inc on line 744.
  • strict warning: Declaration of views_plugin_row::options_validate() should be compatible with views_plugin::options_validate(&$form, &$form_state) in /home/vasp/wwwroot/drupal-6.33/sites/all/modules/views/plugins/views_plugin_row.inc on line 134.
  • strict warning: Declaration of views_plugin_row::options_submit() should be compatible with views_plugin::options_submit(&$form, &$form_state) in /home/vasp/wwwroot/drupal-6.33/sites/all/modules/views/plugins/views_plugin_row.inc on line 134.
最新版本: 
2.4.1
评分: 
3

简介  
Viewmol是一个开源的计算化学程序图形前端。可以用它产生用于计算的分子结构并显示计算结果。商业软件MAPS的显示就是基于Viewmol。

功能  
创建和编辑分子
用线图、棒图、球棍和CPK模型显示分子结构
跟踪几何优化或MD轨迹
动画显示简谐振动,并可保存为电影文件
绘制IR,Raman和非弹性中子散射谱
绘制MO能级或态密度
绘制基函数,分子轨道和电子密度
绘制指定格点的特性
对于某一构型,显示作用于每一原子的力
计算分子的热力学量
显示结果可保存为TIFF,PNG,HPGL或PostScript文件
到Povray的接口
内嵌的Python解释程序用于自动控制
支持大量的输入输出格式,并且用户也可很容易地添加。目前支持的有:Gaussian输出,Discover文件,DMol3输出,Gamess输出,Gulp输出,Mopac输出,PDB文件,PQS输出,Turbomole文件,以及OpenBabel支持的分子结构
Viewmol可以产生的输入文件有:Turbomole文件,Accelrys.car和.arc文件,Gaussian输入文件,MDL文件,以及OpenBabel支持的分子结构