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DGrid

作者或出品公司: 
不详
最新版本: 
4.6
评分: 
3

DGrid程序用于在等距离格点上产生特性值,并进行特性分析,包括电子局域函数(ELF),能量密度,等。支持的量子化学程序输出格式有:ADF(TAPE21),GAMESS(输出文件,WFN文件),Gaussian(格式化的检查点文件,WFN文件),MOLCAS(molden),MOLPRO(molden),Turbomole(molden),Elk(输出文件)。

VEDA

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最新版本: 
4.0
评分: 
3

VEDA(Vibrational Energy Distribution Analysis;振动能量分布分析)程序把IR/拉曼光谱的直角坐标简正模式转化成内坐标,可以更直观地观察分子运动。程序可以自动从Gaussian94/98/03输出文件(.log和.fch)提取所需的数据。

GEN1INT

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最新版本: 
0.2.1
评分: 
3

Gen1Int是一套Fortran 90库函数,用于求解高斯函数单电子积分及其几何导数。具有到Dalton程序的接口。

参考文献:Int. J. Quantum Chem. 111, 858–872, 2011

CRYSCOR

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最新版本: 
09
评分: 
3

简介
CRYSCOR对1D,2D,和3D周期性非导体材料进行关联级别的电子结构计算,目前执行局域二阶Møller-Plesset微扰理论(LMP2)。

功能  
1. 使用周期性LCAO代码Crystal提供的Hartree-Fock解
2. 局域关联方案类似于分子计算(如MOLPRO)中所使用的技术
3. 双电子积分用密度拟合(对近距离电子对)和多极近似(对远距离电子对)技术高效求解
4. 虚空间关于参考HF空间的展开可以使用双基组方案
5. 计算得到LMP2能量和轨道非松弛LMP2级别的特性

FGH1D

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最新版本: 
不详
评分: 
3

一维势函数的振动能级拟合程序。程序有一些备选的势函数(如Morse势函数,双势阱,余弦,方势阱,等),可以在图形界面下选择,并输入有关的参数。若是来自量子化学计算的能量数据(能量单位:波数;键长:埃),可以存成数据文件后由程序读取,或者直接从剪切板读取。限制为:数据点个数必须是偶数。另外,如果数据点比较粗糙,需要插值,做法是在左侧的Range中增加点数(一般一、二百个即可,多了计算会很慢)。除了拟合光谱常数外,程序还可以显示振动波函数,进行热化学计算,等。

InteGriTy

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最新版本: 
不详
评分: 
3

InteGriTy是用Fortran90编写的程序包,使用AIM(分子中的原子)方法进行电子密度的拓扑分析,以及用图形工具显示临界点,键路径或原子盆。

DFTB+

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最新版本: 
1.2
评分: 
3

简介
基于密度泛函理论的紧束缚程序。注册后下载。参数文件需要另外注册和下载,见http://www.dftb.org

功能
1. 非SCC和SCC计算:团簇/分子体系;周期体系(任意k点取样,能带结构计算)
2. 可以做l-壳层求解计算
3. 自旋极化计算(共线和非共线自旋)
4. 结构和格点优化
5. 束缚结构优化(直角坐标)
6. 振动频率计算
7. 分子动力学(NVE,NPH,NVT,NPT系综)
8. 色散校正(vdW相互作用)
9. 三阶现场校正(改善氢键)
10.处理f电子
11.LDA+U(DFTB+U)
12.自旋轨道耦合
13.赝自相关校正
14.QM/MM耦合考虑外部点电荷
15.OpenMP并行
16.代码自动测试
17.用户友好,可扩展输入格式(HSD或XML)
18.附加工具产生立方文件,用于显示电荷分布、分子轨道等

动力学蒙特卡洛方法(KMC)及相关讨论

动态模拟在目前的计算科学中占据着非常重要的位置。随着计算能力和第一原理算法的发展,复杂的动态参数(扩散势垒、缺陷相互作用能等)均可利用第一原理计算得出。因此,部分复杂的体系动态变化,如表面形貌演化或辐射损伤中缺陷集团的聚合-分解演变等,已可以较为精确的予以研究。KMC——动力学蒙特卡洛方法(kinetic Monte Carlo)原理简单,适应性强,因此在很多情况下都是研究人员的首选。此外,KMC在复杂体系或复杂过程中的算法发展也非常活跃。本文试图介绍KMC方法的基础理论和若干进展。

KMC方法基本原理

在原子模拟领域内,分子动力学(molecular dynamics, MD)具有突出的优势。它可以非常精确的描述体系演化的轨迹。一般情况下MD的时间步长在飞秒(TeX Embedding failed!s)量级,因此足以追踪原子振动的具体变化。但是这一优势同时限制了MD在大时间尺度模拟上的应用。现有的计算条件足以支持MD到10 ns,运用特殊的算法可以达到10 TeX Embedding failed!s的尺度。即便如此,很多动态过程,如表面生长或材料老化等,时间跨度均在s以上,大大超出了MD的应用范围。有什么方法可以克服这种局限呢?

FHI-aims

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最新版本: 
16.03.28
评分: 
4

FHI-aims使用全电子的数值原子轨道和全势,进行分子、固体的从头电子结构模拟。

TeraChem

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最新版本: 
1.9
评分: 
4

运行于64位Linux系统下,专门为运行NVIDIA GPU架构而设计,用于一般目的的量子化学软件。比传统的基于CPU的代码快1000倍。可以申请测试版。

功能:
限制性Hartree-Fock和Kohn-Sham的单点能及梯度计算。
各种泛函(BLYP,B3LYP,PBE,等)和各种DFT格点(每个原子有800~80,000格点)。
结构优化。
从头分子动力学(NVE和NVT系综)。
支持多GPU系统。
支持大分子,可以直接读写PDB文件。
包含NBO 6,进行NBO分析。

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